时间： 2024年01月24日（周三）
讲座背景：
蛋白质质谱法是指使用质谱法对蛋白质进行研究和表征，包括蛋白质的定量、分析、相互作用作图和翻译后修饰的鉴定。蛋白质质谱法也可以称为基于质谱的蛋白质组学。基于质谱的蛋白质组学包括三种方法：自上而下（top-down，TD）、自中而下（middle-down，MD）和自下而上（bottom-up，BU）的蛋白质组学：
Mascot是一个基于HTTP网络服务的平台，支持用户从本地或在线提交任意数量的谱图进行搜库鉴定和定量分析。其由Server、Distiller与Daemon 组成，其中Server负责执行核心搜索、Distiller负责峰提取与定量分析，而Daemon作为操作平台，整合前两个板块，以便更高效地进行批量处理。
（来源于：https://www.rapidnovor.com/what-is-protein-mass-spectrometry/）
本次讲座聚焦于TD蛋白质组学的数据分析。TD技术以完整蛋白质为对象，"上"指准确测定分子质量，"下"通过串联质谱实现碎裂。TD法产生的质谱数据复杂，包含高电荷、大质量离子碎片，碎片重叠增加，修饰位点更多，不同修饰组合导致蛋白质变体预测增多。相较于BU肽段的数据处理，完整蛋白质的谱图更为复杂，数据处理更具挑战。
（来源于SUN Rui-Xiang, LUO Lan, CHI Hao, LIU Chao, HE Si-Min. Top-down Proteomics:The Large-scale Proteoform Identification[J]. Progress in Biochemistry and Biophysics, 2015, 42(2): 101-114）
Mascot的特殊版本"Mascot Top Down"限制在110kDa，自动用于母离子质量大于16kDa的搜索，小于16kDa的自下而上搜索不受影响。康昱盛是Mascot在中国的独家代理与技术支持机构，本期康昱盛将分享Top-Down蛋白质组学数据策略，包括数据上传、峰提取参数、搜索参数设置和结果导出，助您熟练运用Mascot软件解决Top-Down蛋白质组学挑战。
讲座时间：
1月24日（周三）14：30-15：20
讲座详情：
上期讲座《一节课让你学会使用Mascot进行基础蛋白质定量分析》已经同步上传至康昱盛同名B站以及视频号。
此外，我们计划在2月中下旬举办第四次Mascot培训，重点介绍如何联用Mascot-Scaffold系列软件进行蛋白质数据质控分析。感兴趣的朋友们，请持续关注康昱盛官方公众号获取更多信息！
报名方式：
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关于本次会议的任何问题可联系康昱盛官方客服：
RECOMMeEND
Mascot Distiller 几乎可以查看和处理所有目前市场主流仪器类型采集的原始数据。数据文件可以是单一的、低分辨率的质谱扫描结果，也可以是采集于复杂的、高分辨的DDA（数据依赖型采集方法）实验的质谱结果。
Mascot软件工具是针对质谱数据，主要利用肽段序列数据检索的方法来鉴定样本中蛋白质的组成以及翻译后修饰。
我们将于3月22日举办在线讲座，为大家介绍Mascot和Scaffold软件的功能，展示分析结果，并通过软件实操让大家更加直观地了解蛋白质组学完整数据分析流程。
康昱盛将于4月27日至28日在北京举办第七届蛋白质组学鉴定行业标准软件Mascot培训班。
康昱盛将于2023年7月14日举办“2023抗体药物发现与设计专题研讨会”
讲座主题：如何使用Mascot进行基础蛋白质定量分析？
