时间： 2024年03月28日（周四）
Blast2GO介绍：
Blast2GO是一款面向生物学家的集成解决方案，用于基于基因本体词汇表对DNA或蛋白质序列进行高通量和自动功能注释的软件。Blast2GO通过精心设计的算法优化同源序列的功能转移，该算法考虑相似性、同源性扩展、选择的数据库、GO层次结构以及原始注释的质量。该工具包括用于注释结果的可视化、管理和统计分析的众多功能，包括基因集富集分析。该应用程序支持InterPro、enzyme codes、KEGG途径、GO有向无环图（DAG）和GOSlim。Blast2GO因其多功能性、安装简便且使用友好而成为植物基因组学研究的合适工具。相信很多生物工程师对这个软件十分熟悉。
Blast2GO应用示意图 (Conesa A, Götz S. Int J Plant Genomics. 2008;2008:619832.）
Blast2GO是BioBam开发的产品，适用于（但不限于）非模式物种且用户友好，只需很少的生物信息学工作即可运行。Blast2GO原先作为一个独立的模块，现在已经并入到OmicsBox的功能分析模块中。
Blast2GO在基因组学和蛋白组学中的应用：
微阵列实验、蛋白互作网络研究、基因组/转录组分析或单核苷酸多态性 （SNP）观察是获得分子生物学新见解的有前途的方法。功能注释是数据分析的关键步骤。由于高通量测序技术的快速发展和全球低成本表达序列标签（EST）测序项目的增多，出现了越来越多的新颖、未定性的序列数据，这就要求进行快速、可靠的功能注释，以促进相关实验的生物学解释。因此，标准化的功能注释至关重要。基因本体（Gene Ontology，GO）是基因和蛋白质序列最广泛的功能注释模式，它已成为几乎所有公共数据库的事实标准。
1.利用带有Blast2GO功能模块进行全基因组功能注释，我们可以对基因组从头测序的CDS序列进行功能注释。
1）通过BLAST进行序列比对；
2）通过InterProScan进行域搜索；
3）使用EggNOG-Mapper进行直系同源组搜索；
4）基因本体图谱。
GO注释条形图
2.利用带有Blast2GO功能模块为差异表达数据进行富集分析。
表格中组合途径分析结果的部分视图
Reactome和KEGG数据库中每个类别发现和通路富集数量以及可视化
3.利用带有Blast2GO功能模块为蛋白进行功能注释与富集分析。
使用Blast2GO分析对从牛、绵羊、山羊和水牛的奶油中分离出的免疫系统相关蛋白质进行功能注释和富集(Felice,Valeria D et al.Foods(Basel,Switzerland).Nov.2021)
讲座主题：
转录组学&蛋白组学富集分析(OmicsBox功能分析)
讲座时间：
3月28日（周四）16:00-17:00
主讲嘉宾：
Stefan Götz，BioBam首席执行官，毕业于瓦伦西亚理工大学并获得生物信息学博士学位。2011年，Stefan创建了BioBam并任BioBam的首席执行官。
软件介绍：
OmicsBox由不同的模块组成，每个模块都有一组特定的工具和功能，旨在执行不同类型的分析，例如从头基因组组装、遗传变异分析、差异表达分析和微生物组数据的分类学分类，包括功能解释和丰富的结果可视化。功能分析模块包括流行的Blast2GO注释方法，使OmicsBox特别适合非模式生物研究。已有15000+的科学研究引用，适用于任何装有Windows、Linux或Mac的标准PC或笔记本电脑。
报名方式：
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注：报名截止日期为3月27日。入会链接（Zoom）将于3月27日发送至您报名的邮箱，如未收到请联系我们！
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